// Now playing
Shinji Ikari terpuruk secara emosional setelah kematian teman dekatnya. Dengan sang putra yang secara mental tidak mampu mengemudikan robot humanoid Evangelion Unit-01, NERV milik Gendou Ikari berlomba melawan organisasi bayangan SEELE untuk melihat siapa yang bisa melaksanakan rencana utama mereka lebih dulu. SEELE ingin menciptakan sosok seperti dewa dengan menyatukan jiwa mereka ke unit Evangelion, sementara Gendou ingin mengembalikan seluruh umat manusia menjadi satu makhluk primordial agar bisa bersatu kembali dengan Yui, istrinya yang telah meninggal.SEELE melepaskan kekuatan militernya dalam invasi mematikan ke markas NERV. Saat pasukan SEELE membantai ilmuwan dan personel keamanan NERV, Asuka Langley Souryuu mengemudikan Evangelion Unit-02 dalam pertahanan terakhir yang putus asa melawan persenjataan terberat SEELE. Pertempuran berkecamuk, dan Shinji yang depresi bersembunyi jauh di dalam markas NERV. Dengan nasib dunia berada di tangan Shinji, Kapten Misato Katsuragi memburu bocah remaja itu saat masyarakat runtuh di sekeliling mereka.
